歡迎進入韦德网站官方入口!
技術文章
首頁 > 技術文章 > Phusion高保真聚合酶中的戰鬥機

Phusion高保真聚合酶中的戰鬥機

 更新時間:2012-11-27 點擊量:2586

 如果PCR產(chan) 物需要進行後繼的克隆表達研究,需要進行高保真度PCR以減少PCR過程中出錯而造成的點突變,我們(men) 通常會(hui) 選擇高保真聚合酶。一般的高保真聚合酶因為(wei) 本身的校驗功能注定了效率低,產(chan) 量低,條帶弱,時間慢。的高保真酶Pfu的效率大概隻有韦德唯一官方酶的1//5。常有人感歎“又貴又不好用(指產(chan) 量低)”!為(wei) 了提率,有些公司又推出了混合酶,將韦德唯一官方與(yu) 帶校驗功能的聚合酶混合,中庸的結果就是效率不如韦德唯一官方酶,保真度不如Pfu,一般就比韦德唯一官方高3倍,價(jia) 格還不便宜。

Finnzymes公司獨辟蹊徑,將雙鏈結合蛋白(紫色)與(yu) 一種新型的具有校對功能的類熱球菌酶(綠色)融合,形成了一種*的高性能聚合酶——Phusion® 聚合酶。這下,兩(liang) 個(ge) 問題都解決(jue) 了。

 


 
圖1. Phusion 聚合酶的*結構

快人一步

由於(yu) 這項*的融合技術,Phusion 聚合酶合成的速度和準確度是以往任何單一酶都難以企及,即使是zui複雜的模板,也能準確、快速地完成反應。與(yu) 其他酶相比,Phusion 聚合酶在每次與(yu) 的結合反應中都能夠摻入更多的核苷酸,其高處理能力大大縮短了延伸步驟的時間,進而加快了整個(ge) 反應的進行。它的延伸速度是Pfu酶的10倍,比韦德唯一官方酶還要快一倍,達到15-30秒/kb。如果你還想更快,可以選擇Phusion® Flash快速高保真聚合酶,每kb 堿基的延伸時間僅(jin) 為(wei) 15 秒或更少,反應時間zui短,酶的用量顯著低於(yu) 其他常見的聚合酶。Phusion 聚合酶的高速度和率使得它能在zui短時間內(nei) 獲得大量產(chan) 物。

Finnzymes曾做過實驗,從(cong) Thermus sp.基因組文庫中隨機挑選16個(ge) 克隆,並用3種不同的耐熱聚合酶進行擴增。結果顯示,Phusion® 聚合酶具有強勁的性能和速度,它能夠成功擴增出隨機挑選的16個(ge) 片段中的15個(ge) (94%),並且產(chan) 量很高。而Pfu 聚合酶的成功率僅(jin) 為(wei) 56%,韦德唯一官方 聚合酶成功率也才62%,二者的產(chan) 量明顯低於(yu) Phusion® 聚合酶。而且從(cong) 圖中可以看出,Phusion® 聚合酶的延伸時間和酶用量均顯著低於(yu) Pfu酶,與(yu) 韦德唯一官方相當,但產(chan) 量更高。如此強勁的性能,無出其右。


 
圖2. Phusion 聚合酶集超高保真度、快速和強勁的性能於(yu) 一體(ti)

 

節約時間,節約用量

由於(yu) 其結構*,Phusion 聚合酶的效率非常高。在PCR反應中,該酶的用量顯著低於(yu) 其他常見的聚合酶。研究人員曾使用3種不同的聚合酶擴增一個(ge) 長為(wei) 3.8kb的人β球蛋白基因。使用Phusion 聚合酶不但可成功擴增出此3.8kb的基因組片段,且退火和延長步驟僅(jin) 需1分鍾,明顯快於(yu) 其他兩(liang) 種聚合酶。一個(ge) 單位的Phusion 聚合酶所獲得的產(chan) 物高於(yu) 5個(ge) 單位的Pfu 聚合酶的產(chan) 量,比2.5個(ge) 單位改良的Pfu的產(chan) 量也高得多。

圖3. 用更少的酶 —— 獲得更多的產(chan) 物

適用性強

此外,Phusion 聚合酶能夠zui大限度地容忍各種PCR抑製劑,因此隻需要很少的優(you) 化步驟就可以進行非常的擴增。這個(ge) 特點也催生了的直接PCR。對於(yu) 血液、組織等多種樣品,甚至是FFPE樣品,無需提取,即可直接開展高保真PCR擴增。

Phusion 聚合酶有多個(ge) 版本可供選擇。 除了上麵提到的Phusion Flash,還有Phusion熱啟動II高保真聚合酶,其高度特異性和*聚合能力決(jue) 定了它是熱啟動PCR的理想選擇。幾種酶的特點和產(chan) 品形式如下:

 

 

Phusion 高保真聚合酶

Phusion 熱啟動II高保真聚合酶

Phusion Flash
高保真聚合酶

Phire 熱啟動II聚合酶

酶的 
特點

平端或3’ A端

平端

平端

平端

平端

目標片段長度

≤ 20 kb

≤ 20 kb

≤ 20 kb

≤ 7.5 kb

熱啟動

推薦延伸時間

15-30 s/kb

15-30 s/kb

15 s/kb

10-15 s/kb

校正功能

一般

保真度 vs. 韦德唯一官方

52x

52x

25x

2x

產(chan) 品 
形式

單酶1

-

Master Mix2

-

-

試劑盒3

-

-

-

價(jia) 格便宜 選擇多樣

Phusion 聚合酶性能如此強勁,而價(jia) 格卻相當親(qin) 民。以Phusion高保真PCR 試劑盒(含除模板引物外其他所需試劑)為(wei) 例,目錄價(jia) 隻需555元即可進行125次反應(每次20μl ),單次反應成本才4.44元,1878 元即可有500次反應,簡直太給力了!
Phusion 聚合酶(含酶,緩衝(chong) 液,Mg離子,DMSO)隻要879元/100U,足夠做100次50ul反應。要知道PfuUltra目錄價(jia) 100U的單酶(40次反應)也不止1900啊!

Phusion 聚合酶還提供其他多種選擇,熱啟動的高保真單酶(1067元/100U),還有針對GC含量豐(feng) 富模板,或者特別含HF緩衝(chong) 液的預混合酶MasterMix係列產(chan) 品。

 

更少出錯

更重要的是,Phusion 聚合酶是目前市場上保真度zui高的熱穩定性聚合酶。使用改良的lacI方法檢測,Phusion 聚合酶的錯配率比韦德唯一官方 聚合酶低約50倍, 比Pfu 聚合酶低6倍,是高保真PCR的理想選擇。對於(yu) 研究基因功能,需要從(cong) 事定點突變,基因克隆和表達分析等工作來說,Phusion 聚合酶無疑是更好的選擇。

韦德唯一官方酶出錯幾率較高,且平均擴增長度不超過3.5kb。而Phusion 聚合酶則可擴增10kb以上(<20kb)的超長片段,保真度高不容易出錯,再加上擴增速度比普通高保真酶快得多,故使用Phusion 聚合酶可以有效節約很多時間。